Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms