Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRXP46100 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms