Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms