Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDH1P40925 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDH1P40925 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDH1P40925 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDH1P40925 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDH1P40925 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDH1P40925 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDH1P40925 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDH1P40925 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDH1P40925 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms