Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP6P35125 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP6P35125 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP6P35125 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP6P35125 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP6P35125 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP6P35125 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP6P35125 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms