Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRMP28827 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRMP28827 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRMP28827 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRMP28827 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRMP28827 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRMP28827 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PTPRMP28827 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PTPRMP28827 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PTPRMP28827 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRMP28827 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms