Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms