Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms