Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms