Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT1P26358 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms