Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRZ1P23471 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms