Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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