Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms