Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms