Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASTP20810 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASTP20810 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASTP20810 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASTP20810 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASTP20810 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASTP20810 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASTP20810 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASTP20810 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASTP20810 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASTP20810 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASTP20810 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASTP20810 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms