Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms