Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN2P17655 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN2P17655 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms