Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP1P11387 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP1P11387 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP1P11387 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms