Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHGAP10645 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHGAP10645 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms