Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOP08100 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOP08100 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHOP08100 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHOP08100 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms