Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPBP07199 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPBP07199 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms