Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOA4P06727 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOA4P06727 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOA4P06727 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOA4P06727 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms