Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms