Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOC1P02654 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC1P02654 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC1P02654 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms