Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms