Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms