Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF253O75346 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF253O75346 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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