Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms