Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9AO75110 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9AO75110 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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