Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms