Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDIL3O43854 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms