Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF1O43189 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms