Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCAO15360 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCAO15360 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCAO15360 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCAO15360 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCAO15360 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCAO15360 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCAO15360 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms