Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNMO15061 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms