Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms