Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms