Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGPD3A6NKT7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms