Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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