Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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