Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms