Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms