Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms