Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms