Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NRXN1Q9ULB1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms