Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNL1Q9UK58 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNL1Q9UK58 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms