Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms