Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms