Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP1Q9NZU7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP1Q9NZU7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms