Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIN1Q9NXP7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms