Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUOX2Q9NRD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms